Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRX1P78414 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRX1P78414 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms