Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAE1P78406 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAE1P78406 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAE1P78406 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms