Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms