Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL23P62829 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPL23P62829 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms