Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS3AP61247 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms