Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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