Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAV3P56539 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAV3P56539 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAV3P56539 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV3P56539 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV3P56539 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms