Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms