Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DAP3P51398 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms