Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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