Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP153P49790 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP153P49790 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms