Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms