Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCLMP48507 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCLMP48507 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLMP48507 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLMP48507 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLMP48507 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLMP48507 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLMP48507 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLMP48507 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLMP48507 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLMP48507 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLMP48507 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLMP48507 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms