Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A9P48067 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms