Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA4P43694 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms