Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD52P43351 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms