Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms