Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZEB1P37275 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms