Protein–RNA interactions for Protein: P36575

ARR3, Arrestin-C, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARR3P36575 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARR3P36575 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARR3P36575 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms