Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6BP35913 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6BP35913 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms