Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
ATP7BP35670 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
ATP7BP35670 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7BP35670 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7BP35670 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms