Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms