Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms