Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms