Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms