Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP1P30622 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP1P30622 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms