Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA5P30532 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA5P30532 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms