Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF1P30408 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms