Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms