Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTKP29376 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTKP29376 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTKP29376 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LTKP29376 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTKP29376 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTKP29376 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTKP29376 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTKP29376 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTKP29376 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTKP29376 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTKP29376 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms