Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2E1P29083 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2E1P29083 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms