Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD34P28906 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD34P28906 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms