Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms