Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms