Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB5P28074 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms