Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PLNP26678 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PLNP26678 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms