Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO2P25791 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO2P25791 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO2P25791 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO2P25791 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO2P25791 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO2P25791 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO2P25791 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO2P25791 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO2P25791 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms