Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5A1P25705 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms