Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRGP23470 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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