Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LIG1P18858 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIG1P18858 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIG1P18858 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIG1P18858 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIG1P18858 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIG1P18858 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms