Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF3P18847 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF3P18847 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF3P18847 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF3P18847 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms