Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRAP18433 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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