Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VCLP18206 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VCLP18206 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VCLP18206 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VCLP18206 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms