Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA1P17302 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA1P17302 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA1P17302 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA1P17302 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA1P17302 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA1P17302 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA1P17302 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms