Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HPGDP15428 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HPGDP15428 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HPGDP15428 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms