Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRAFP15056 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRAFP15056 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRAFP15056 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRAFP15056 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRAFP15056 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRAFP15056 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRAFP15056 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRAFP15056 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRAFP15056 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRAFP15056 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRAFP15056 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRAFP15056 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms