Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms