Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms