Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms