Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms